36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0976 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 109 aa  219  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  63.21 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.27 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.6 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  51.4 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.77 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  49.53 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  48.6 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.79 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.23 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.4 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  45.28 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.25 
 
 		 119 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.81 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.32 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.96 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.95 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  39.45 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.61 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  39.77 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.64 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.66 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.59 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.03 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2528  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.45 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.82 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.09 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  26.67 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.46 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  26.67 
 
 		 117 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>