29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4772 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 97 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  68.04 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.08 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.08 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.17 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.04 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.55 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.52 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  44.79 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.88 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.88 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.88 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.79 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.21 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.81 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.96 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.76 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.63 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.95 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.36 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.54 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.22 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  36.46 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  40.28 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0676  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.26 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.56 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>