39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3665 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 110 aa  219  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  56.19 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  55.24 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.33 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.63 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.01 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.83 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.83 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.83 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.94 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  48.11 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.15 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.63 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.45 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.99 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.99 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.21 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  42.31 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.99 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.25 
 
 		 114 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.19 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.16 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  38.18 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  46.05 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.04 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.95 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.97 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.9 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.83 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.93 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.66 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.7 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>