56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0793 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
107 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
107 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
107 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.21 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  57.01 
 
 
107 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  56.07 
 
 
111 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.83 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.34 
 
 
107 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.27 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.73 
 
 
108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.11 
 
 
112 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 
108 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.3 
 
 
114 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.44 
 
 
119 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.37 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.59 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  47.17 
 
 
107 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.88 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.17 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.12 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.74 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  39.78 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.95 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  30.43 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.38 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.73 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  29.35 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.26 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.17 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.26 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.26 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.13 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.35 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.42 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.91 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.88 
 
 
116 aa  42  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.09 
 
 
116 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2603  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.83 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.996132  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  26.09 
 
 
116 aa  40  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  26.09 
 
 
116 aa  40  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.09 
 
 
116 aa  40  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>