31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0215 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0215  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  326  8e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0664  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 
156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0610  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2125  AsnC/Lrp family regulatory protein  57.62 
 
 
156 aa  193  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.4837  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1639  AsnC/Lrp family regulatory protein  56.95 
 
 
156 aa  191  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.756189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0366  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
154 aa  140  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.552602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  31.3 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  24.8 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  28.8 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  27.92 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  25.4 
 
 
150 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.4 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  25.4 
 
 
148 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  29.92 
 
 
143 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  28.8 
 
 
152 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  23.66 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
295 aa  41.6  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  24.81 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.2 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  28.69 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  25.41 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>