45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3359 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3359  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0703032  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2041  hypothetical protein  53.01 
 
 
165 aa  161  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3359  hypothetical protein  47.09 
 
 
194 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2446  hypothetical protein  48.43 
 
 
160 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.357149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3150  hypothetical protein  44.16 
 
 
160 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2824  hypothetical protein  42.17 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.000998025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2803  protein of unknown function DUF1321  42.26 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924782  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2731  hypothetical protein  45.51 
 
 
202 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2544  protein of unknown function DUF1321  42.26 
 
 
171 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2027  hypothetical protein  43.45 
 
 
171 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688621  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  44.71 
 
 
172 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4013  protein of unknown function DUF1321  42.05 
 
 
178 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2352  hypothetical protein  42.31 
 
 
182 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0771  hypothetical protein  41.99 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2889  protein of unknown function DUF1321  49.64 
 
 
217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547275  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6105  hypothetical protein  43.26 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2784  protein of unknown function DUF1321  49.64 
 
 
220 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.297905  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1418  hypothetical protein  48.59 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800205  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1404  hypothetical protein  39.89 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4523  hypothetical protein  49.31 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2662  hypothetical protein  53.04 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.950467  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1361  hypothetical protein  39.89 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1005  hypothetical protein  42.42 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1982  hypothetical protein  39.55 
 
 
177 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0705433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1773  hypothetical protein  45.45 
 
 
194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2716  hypothetical protein  43.37 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2031  hypothetical protein  43.02 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1093  hypothetical protein  52.54 
 
 
208 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0697  protein of unknown function DUF1321  53.04 
 
 
211 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0730761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0599  protein of unknown function DUF1321  41.9 
 
 
180 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0962477 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0930  hypothetical protein  35.23 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2205  hypothetical protein  38.24 
 
 
196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00100691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1336  hypothetical protein  43.95 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2333  hypothetical protein  38.37 
 
 
175 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0025839  normal  0.298167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1150  protein of unknown function DUF1321  38.27 
 
 
181 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34788  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2139  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0813  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0722  hypothetical protein  39.35 
 
 
153 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1450  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2391  hypothetical protein  41.82 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1909  hypothetical protein  35.33 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_002978  WD0128  hypothetical protein  34.69 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.547253  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0462  hypothetical protein  35.14 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0325  hypothetical protein  27.92 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000000262702  n/a   
 
 
 
NC_007799  ECH_0744  hypothetical protein  29.56 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000544943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>