45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2352 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2352  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2731  hypothetical protein  76.5 
 
 
202 aa  276  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4013  protein of unknown function DUF1321  65.05 
 
 
178 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  68.31 
 
 
172 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3359  hypothetical protein  68.13 
 
 
194 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6105  hypothetical protein  65.38 
 
 
175 aa  230  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2031  hypothetical protein  64.84 
 
 
174 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1418  hypothetical protein  54.04 
 
 
198 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800205  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4523  hypothetical protein  51.21 
 
 
208 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2889  protein of unknown function DUF1321  48.18 
 
 
217 aa  187  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547275  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2784  protein of unknown function DUF1321  48.88 
 
 
220 aa  185  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.297905  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0771  hypothetical protein  54.35 
 
 
184 aa  184  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2662  hypothetical protein  49.07 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.950467  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0697  protein of unknown function DUF1321  50.47 
 
 
211 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0730761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2803  protein of unknown function DUF1321  51.37 
 
 
171 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924782  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2544  protein of unknown function DUF1321  51.37 
 
 
171 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1093  hypothetical protein  50.24 
 
 
208 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2027  hypothetical protein  48.13 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688621  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1361  hypothetical protein  49.24 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1404  hypothetical protein  49.24 
 
 
189 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1982  hypothetical protein  49.73 
 
 
177 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0705433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2824  hypothetical protein  51.09 
 
 
169 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.000998025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2446  hypothetical protein  47.25 
 
 
160 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.357149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1773  hypothetical protein  47.26 
 
 
194 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0599  protein of unknown function DUF1321  47.34 
 
 
180 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0962477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2041  hypothetical protein  61.54 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0930  hypothetical protein  42.08 
 
 
177 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3150  hypothetical protein  47.59 
 
 
160 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2205  hypothetical protein  43.02 
 
 
196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00100691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2716  hypothetical protein  42.86 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1005  hypothetical protein  47.92 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3359  hypothetical protein  53.91 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0703032  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1450  hypothetical protein  42.05 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2333  hypothetical protein  46.11 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0025839  normal  0.298167 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1336  hypothetical protein  52.14 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0722  hypothetical protein  49.09 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2139  hypothetical protein  49.09 
 
 
152 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0813  hypothetical protein  49.09 
 
 
152 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1909  hypothetical protein  49.55 
 
 
153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2391  hypothetical protein  49.55 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1150  protein of unknown function DUF1321  46.28 
 
 
181 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34788  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0462  hypothetical protein  44.14 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0128  hypothetical protein  38.93 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.547253  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0744  hypothetical protein  29.38 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000544943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0325  hypothetical protein  32.84 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000000262702  n/a   
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>