45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2544 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2544  protein of unknown function DUF1321  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2803  protein of unknown function DUF1321  95.91 
 
 		 171 aa  339  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2824  hypothetical protein  78.95 
 
 		 169 aa  270  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.000998025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2027  hypothetical protein  75.44 
 
 		 171 aa  266  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1361  hypothetical protein  62.3 
 
 		 189 aa  215  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1404  hypothetical protein  61.78 
 
 		 189 aa  213  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1773  hypothetical protein  58.46 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1982  hypothetical protein  56.83 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0705433  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0930  hypothetical protein  52.25 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2889  protein of unknown function DUF1321  45.87 
 
 		 217 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547275  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2731  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3359  hypothetical protein  50.84 
 
 		 194 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2352  hypothetical protein  51.37 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2784  protein of unknown function DUF1321  47.06 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.297905  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2662  hypothetical protein  45.41 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.950467  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1418  hypothetical protein  45.1 
 
 		 198 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  49.13 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0697  protein of unknown function DUF1321  52.53 
 
 		 211 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0730761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4523  hypothetical protein  46.45 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6105  hypothetical protein  52.84 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2446  hypothetical protein  48.54 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4013  protein of unknown function DUF1321  48.63 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0771  hypothetical protein  47.87 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2031  hypothetical protein  49.71 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1093  hypothetical protein  45.19 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0599  protein of unknown function DUF1321  45.99 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0962477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2041  hypothetical protein  48.07 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2716  hypothetical protein  46.67 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3150  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1005  hypothetical protein  43.37 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2333  hypothetical protein  48.47 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0025839  normal  0.298167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3359  hypothetical protein  39.88 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0703032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1450  hypothetical protein  43.37 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2205  hypothetical protein  40.12 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00100691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1150  protein of unknown function DUF1321  41.57 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0722  hypothetical protein  48.65 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2139  hypothetical protein  47.75 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0813  hypothetical protein  47.75 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1909  hypothetical protein  48.21 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2391  hypothetical protein  49.11 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1336  hypothetical protein  45.05 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0462  hypothetical protein  40.71 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0128  hypothetical protein  33.54 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.547253  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0325  hypothetical protein  28.48 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000000262702  n/a   
 
 
 
NC_007799  ECH_0744  hypothetical protein  32.14 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000544943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>