45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0697 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0697  protein of unknown function DUF1321  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0730761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1093  hypothetical protein  85.98 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2889  protein of unknown function DUF1321  65.61 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547275  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2784  protein of unknown function DUF1321  64.86 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.297905  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2662  hypothetical protein  64.86 
 
 
217 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.950467  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4523  hypothetical protein  69.01 
 
 
208 aa  261  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0771  hypothetical protein  54.98 
 
 
184 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1418  hypothetical protein  52.73 
 
 
198 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800205  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0599  protein of unknown function DUF1321  47.89 
 
 
180 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0962477 
 
 
-
 
NC_004310  BR1404  hypothetical protein  48.83 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1361  hypothetical protein  48.83 
 
 
189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3359  hypothetical protein  46.67 
 
 
194 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2731  hypothetical protein  49.07 
 
 
202 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  48.34 
 
 
172 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1982  hypothetical protein  47.62 
 
 
177 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0705433  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2352  hypothetical protein  51.17 
 
 
182 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2446  hypothetical protein  55.84 
 
 
160 aa  177  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.357149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1773  hypothetical protein  48.34 
 
 
194 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2544  protein of unknown function DUF1321  52.53 
 
 
171 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2803  protein of unknown function DUF1321  51.9 
 
 
171 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924782  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6105  hypothetical protein  65.52 
 
 
175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2824  hypothetical protein  45.02 
 
 
169 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.000998025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4013  protein of unknown function DUF1321  45.58 
 
 
178 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2027  hypothetical protein  43.46 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688621  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2031  hypothetical protein  61.74 
 
 
174 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2041  hypothetical protein  62.31 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0930  hypothetical protein  39.52 
 
 
177 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1005  hypothetical protein  57.76 
 
 
166 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2716  hypothetical protein  50.36 
 
 
163 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3150  hypothetical protein  52.85 
 
 
160 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2205  hypothetical protein  55.05 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00100691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1336  hypothetical protein  54.87 
 
 
169 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3359  hypothetical protein  52.63 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0703032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1150  protein of unknown function DUF1321  46.15 
 
 
181 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34788  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2333  hypothetical protein  38.24 
 
 
175 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0025839  normal  0.298167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1450  hypothetical protein  45.05 
 
 
159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2139  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0813  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0722  hypothetical protein  45.45 
 
 
153 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1909  hypothetical protein  45.95 
 
 
153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2391  hypothetical protein  44.14 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0462  hypothetical protein  41.44 
 
 
166 aa  87  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0325  hypothetical protein  35.14 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000000262702  n/a   
 
 
 
NC_007799  ECH_0744  hypothetical protein  34.51 
 
 
157 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000544943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0128  hypothetical protein  40.4 
 
 
145 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.547253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>