More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2472 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2472  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  100 
 
 
258 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.51 
 
 
266 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.76 
 
 
266 aa  214  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  43.35 
 
 
262 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.37 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.31 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  41.54 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.97 
 
 
260 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.08 
 
 
259 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.31 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.75 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2465  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.15 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000280945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.62 
 
 
259 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.23 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.75 
 
 
259 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.78 
 
 
259 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.23 
 
 
259 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2742  electron transfer flavoprotein beta-subunit  41.7 
 
 
270 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.78 
 
 
261 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.24 
 
 
264 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.54 
 
 
263 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.5 
 
 
261 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.11 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1725  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.28 
 
 
268 aa  154  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.363421  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.15 
 
 
261 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.19 
 
 
266 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.19 
 
 
266 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  37.85 
 
 
266 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000726772  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.19 
 
 
266 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.5 
 
 
261 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2412  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.15 
 
 
268 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.46 
 
 
259 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.64 
 
 
280 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1346  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.25 
 
 
265 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598656  normal  0.625281 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02780  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.92 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.39 
 
 
251 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0657  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.67 
 
 
271 aa  131  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.553142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.63 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1041  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.11 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0655  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.06 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.85 
 
 
263 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10410  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.16 
 
 
268 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.3 
 
 
257 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.77 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.06 
 
 
262 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  29.77 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1485  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.15 
 
 
262 aa  118  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0507333  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4640  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.58 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.8 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.58 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0719  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.59 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.02869  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.77 
 
 
263 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.31 
 
 
263 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.85 
 
 
262 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.04 
 
 
278 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.41 
 
 
256 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.03 
 
 
261 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2200  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.38 
 
 
259 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.2 
 
 
267 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.93 
 
 
265 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  29.52 
 
 
259 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.66 
 
 
610 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.49 
 
 
601 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.98 
 
 
258 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.82 
 
 
258 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0387  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.77 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  28.74 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1500  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.37 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20554  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0777  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.49 
 
 
288 aa  97.1  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.4 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.07 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1233  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.28 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2716  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.96 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1357  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.25 
 
 
270 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.540226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  27.27 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  28.15 
 
 
271 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.24 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2928  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.88 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  28.25 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  28.69 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.69 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1389  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.64 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.86 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.94 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.22 
 
 
262 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  26.52 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.71 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.36 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1270  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.8 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.464463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  30.96 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.27 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  29.91 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.81 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.72 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  31.8 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.02 
 
 
252 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>