More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10410  electron transfer flavoprotein, beta subunit  100 
 
 
268 aa  517  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1725  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  68.28 
 
 
268 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.363421  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2412  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  63.57 
 
 
268 aa  293  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  57.04 
 
 
264 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  53.56 
 
 
262 aa  261  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1346  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.58 
 
 
265 aa  255  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598656  normal  0.625281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0657  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.19 
 
 
271 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.553142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2465  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.13 
 
 
263 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000280945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.35 
 
 
259 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2742  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.9 
 
 
270 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.39 
 
 
262 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.15 
 
 
263 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.03 
 
 
263 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.85 
 
 
266 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  42.54 
 
 
266 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000726772  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.66 
 
 
266 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.66 
 
 
266 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.66 
 
 
266 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  43.66 
 
 
261 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.35 
 
 
259 aa  191  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.35 
 
 
259 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.64 
 
 
259 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.98 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.01 
 
 
260 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.87 
 
 
259 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.49 
 
 
266 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  43.33 
 
 
259 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.28 
 
 
261 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.38 
 
 
261 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.07 
 
 
280 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.12 
 
 
259 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.52 
 
 
259 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.78 
 
 
259 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40.3 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.75 
 
 
260 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.41 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1041  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.31 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4640  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.3 
 
 
263 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02780  electron transfer flavoprotein, beta subunit  39.26 
 
 
260 aa  132  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.97 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.94 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.65 
 
 
278 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.9 
 
 
610 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.33 
 
 
263 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.73 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0655  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.92 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0572  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.86 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  28.14 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2472  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.06 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.88 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1357  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.29 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.540226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2928  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.65 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.12 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.02 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.1 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.49 
 
 
262 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.03 
 
 
257 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2067  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.23 
 
 
270 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107752  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.82 
 
 
265 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  30 
 
 
259 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30 
 
 
259 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.6 
 
 
256 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.64 
 
 
261 aa  106  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2133  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.95 
 
 
270 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000214154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.19 
 
 
271 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1485  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.52 
 
 
262 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0507333  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6581  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.93 
 
 
272 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1211  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.48 
 
 
270 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.01 
 
 
277 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2267  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.32 
 
 
283 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.3 
 
 
601 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.95 
 
 
270 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.16 
 
 
260 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.62 
 
 
256 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2716  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.46 
 
 
270 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2872  electron transfer flavoprotein  32.66 
 
 
270 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.604288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2787  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.64 
 
 
270 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1603  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.37 
 
 
335 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00422679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.88 
 
 
256 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1500  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.46 
 
 
270 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4448  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.53 
 
 
294 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.96 
 
 
285 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.16 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.68 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.69 
 
 
257 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1466  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.23 
 
 
270 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.69 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  29.59 
 
 
285 aa  99  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3331  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.77 
 
 
264 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.25 
 
 
260 aa  99  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.69 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.69 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.64 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  29.83 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  32.69 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.69 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.34 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.18 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.82 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.69 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>