34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01030 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01030  tricarboxylate carrier, putative  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0228158  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08274  mitochondrial DNA replication protein (Yhm2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04220)  62.96 
 
 
314 aa  354  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78537  mitochondrial carrier protein  63.57 
 
 
301 aa  352  4e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37703  MC family transporter  34.52 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.109941 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35625  predicted protein  29.37 
 
 
346 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02570  succinate:fumarate antiporter, putative  24.65 
 
 
342 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46312  predicted protein  23.51 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07287  Mitochondrial succinate-fumarate antiporter (Eurofung)  23 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532227  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23908  predicted protein  25 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49502  predicted protein  26.03 
 
 
529 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18489  predicted protein  26.87 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0358222  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29031  citrate transport protein  25 
 
 
294 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0488853  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60344  mitochondrial succinate-fumarate transporter  24.73 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0581106  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01450  hypothetical protein  23.83 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01580  tricarboxylate transport protein (ctp), putative  24.23 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.721569  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07569  Mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVW1]  28.75 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0176662  normal  0.34397 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5879  MC family transporter: folate  29.17 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00521533 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_6022  MC family transporter: folate  29.17 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.26277  hitchhiker  0.00241636 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04280  peroxisomal membrane protein Pmp47, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04310)  25.61 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.818719 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47843  predicted protein  33.71 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16237  MC family transporter: succinate/fumarate  21.51 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.200123  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2831  hypothetical protein  26.07 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35949  predicted protein  26.56 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17914  predicted protein  23.22 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0969032  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02690  mitochondrial inner membrane protein, putative  24.81 
 
 
698 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8990  predicted protein  24.03 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23709  predicted protein  23.34 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00469495  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02540  organic acid transporter, putative  23.66 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78946  mitochondrial dicarboxylate transport protein  23.12 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.170378  normal  0.239614 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03461  mitochondrial tricarboxylate transporter (Ctp), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05420)  25.81 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000424304 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08040  transporter, putative  25 
 
 
382 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45267  mitochondrial carrier protein  22.62 
 
 
375 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0835876  normal  0.824386 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12523  predicted protein  24.9 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129345  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35397  integral membrane ornithine transporter of mitochondria  25.13 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.2179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>