22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47843 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47843  predicted protein  100 
 
 
268 aa  557  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28180  MC family transporter  32.68 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00310343 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84609  mitochondrial carrier protein  26.01 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01917  hypothetical protein similar to mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter (Eurofung)  23 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0895332 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16210  predicted protein  26.01 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29031  citrate transport protein  24.82 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0488853  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02540  organic acid transporter, putative  23.46 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08881  Mitochondrial carrier AMCAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1Z8]  25.09 
 
 
326 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01980  carrier protein ymc2, mitochondrial precursor, putative  29.29 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01580  tricarboxylate transport protein (ctp), putative  24.54 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.721569  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44274  mitochondrial carrier protein  27 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78946  mitochondrial dicarboxylate transport protein  25.88 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.170378  normal  0.239614 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10172  mitochondrial 2-oxodicarboxylate carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09660)  22.42 
 
 
306 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0644705  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03461  mitochondrial tricarboxylate transporter (Ctp), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05420)  24.25 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000424304 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66704  Mitochondrial aspartate/glutamate carrier protein Aralar/Citrin (contains EF-hand Ca2+-binding domains)  20.19 
 
 
721 aa  46.6  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186703  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02690  mitochondrial inner membrane protein, putative  23.04 
 
 
698 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25107  MC family transporter: dicarboxylate/tricarboxylate  25.35 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06530  carnitine/acyl carnitine carrier, putative  23.6 
 
 
354 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01030  tricarboxylate carrier, putative  33.71 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0228158  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16269  MC family transporter: uncoupling protein  23.35 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44281  MC family transporter: 2-oxodicarboxylate  22.17 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12405  predicted protein  25.96 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>