19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46312 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46312  predicted protein  100 
 
 
312 aa  650    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78537  mitochondrial carrier protein  25.27 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02570  succinate:fumarate antiporter, putative  25.17 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37703  MC family transporter  26.21 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.109941 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08274  mitochondrial DNA replication protein (Yhm2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04220)  23.4 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07287  Mitochondrial succinate-fumarate antiporter (Eurofung)  25.55 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532227  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01030  tricarboxylate carrier, putative  23.51 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0228158  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35625  predicted protein  27.71 
 
 
346 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49502  predicted protein  24.14 
 
 
529 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84609  mitochondrial carrier protein  23.93 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44274  mitochondrial carrier protein  23.5 
 
 
306 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06690  mitochondrial carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05390)  22.07 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000195392  normal  0.158418 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23709  predicted protein  23.77 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00469495  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35397  integral membrane ornithine transporter of mitochondria  27.5 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.2179 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01450  hypothetical protein  24.85 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13856  predicted protein  19.13 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10823  mitochondrial folate carrier protein Flx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05170)  25 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.793163 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57133  Mitochondrial FAD carrier protein  21.66 
 
 
323 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01580  tricarboxylate transport protein (ctp), putative  21.05 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.721569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>