48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05040 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL05040  beta DNA polymerase, putative  100 
 
 		 556 aa  1157    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06114  terminal deoxynucleotidyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08840)  28.57 
 
 		 665 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.944329  normal  0.0258193 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01231  DNA polymerase POL4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10480)  24.27 
 
 		 642 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01570  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34689  predicted protein  24.76 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  24.62 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49149  predicted protein  23.93 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  25.85 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  25 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  24.78 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  23.6 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  20.54 
 
 		 577 aa  57  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  25.07 
 
 		 574 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  23.44 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  23.95 
 
 		 580 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  23.19 
 
 		 579 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  23.18 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  24.51 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  21.64 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  22.87 
 
 		 576 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  23.35 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  24.78 
 
 		 577 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  24.45 
 
 		 598 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  24.57 
 
 		 586 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  23.06 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  23.72 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  22.63 
 
 		 588 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  23.69 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  23.89 
 
 		 570 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  36.25 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  22.07 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  23.89 
 
 		 575 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  23.01 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  24.1 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  23.08 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  23.08 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  21.79 
 
 		 592 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  21.57 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  22.07 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  22.07 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  22.07 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  25 
 
 		 578 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  23.12 
 
 		 583 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  22.1 
 
 		 574 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  23.46 
 
 		 578 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  22.19 
 
 		 562 aa  43.9  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  21.66 
 
 		 576 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  24.34 
 
 		 576 aa  43.5  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>