55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01570 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI01570  conserved hypothetical protein  100 
 
 
695 aa  1438    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01231  DNA polymerase POL4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10480)  32.49 
 
 
642 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49149  predicted protein  32.46 
 
 
570 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34689  predicted protein  32.95 
 
 
340 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06114  terminal deoxynucleotidyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08840)  28.08 
 
 
665 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.944329  normal  0.0258193 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05040  beta DNA polymerase, putative  26.25 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  26.14 
 
 
582 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  30.66 
 
 
584 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  26.72 
 
 
586 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  30.12 
 
 
583 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  25.07 
 
 
577 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  26.7 
 
 
582 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  26.7 
 
 
582 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  28.17 
 
 
574 aa  64.7  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  26.38 
 
 
574 aa  64.3  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  30.3 
 
 
605 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  28.75 
 
 
575 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  29.19 
 
 
560 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  28.57 
 
 
579 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 
570 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  26.99 
 
 
592 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 
562 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  24.07 
 
 
588 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  29.81 
 
 
580 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  24.36 
 
 
598 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  26.95 
 
 
576 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  25.12 
 
 
576 aa  59.3  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  26.95 
 
 
576 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 
576 aa  58.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  27.61 
 
 
591 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  27.61 
 
 
591 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  27.61 
 
 
591 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  27.11 
 
 
562 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  23.05 
 
 
574 aa  57.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  27.5 
 
 
592 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  32.52 
 
 
584 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  29.38 
 
 
580 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  26.92 
 
 
589 aa  56.6  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  25.49 
 
 
580 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.5 
 
 
740 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  26.83 
 
 
574 aa  54.7  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  27.5 
 
 
650 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  27.98 
 
 
586 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  27.5 
 
 
642 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  28.27 
 
 
588 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  27.61 
 
 
614 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  27.44 
 
 
577 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  25.7 
 
 
580 aa  51.2  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  27.76 
 
 
576 aa  51.2  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  25.77 
 
 
584 aa  51.2  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  27.33 
 
 
578 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  27.33 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  35.9 
 
 
576 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  25.9 
 
 
570 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  27.38 
 
 
589 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>