27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03910 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI03910  transmembrane protein, putative  100 
 
 
573 aa  1174    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.2 
 
 
722 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  23.56 
 
 
714 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  22.4 
 
 
722 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  25.89 
 
 
265 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  24.39 
 
 
714 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  23.9 
 
 
717 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  24.86 
 
 
282 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 
282 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  24.66 
 
 
246 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  25.48 
 
 
252 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.04 
 
 
705 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  22.15 
 
 
242 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06220  expressed protein  25.21 
 
 
805 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.067136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  22.03 
 
 
722 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  22.36 
 
 
716 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.35 
 
 
713 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  21.48 
 
 
238 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  20.66 
 
 
738 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  22.82 
 
 
746 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  23.57 
 
 
297 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  23.88 
 
 
185 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  23.32 
 
 
228 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  21.43 
 
 
267 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  23.86 
 
 
224 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  25 
 
 
704 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>