46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3547 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3547  outer membrane protein  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00647416  normal  0.0413826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  40.36 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  32.65 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  23.18 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  24.71 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  26.56 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  26.24 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  22.63 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  24.06 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  22.09 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.61 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  26.87 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  26.89 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  24 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  25 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  30.47 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  25 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  25.53 
 
 		 173 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  24.18 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  26.89 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  24 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  25.21 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  23.98 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  23.44 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  26.61 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  24.71 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  22.46 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  23.85 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  23.39 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  28.03 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  23.28 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  27.34 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  21.71 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  24.43 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  21.71 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  21.8 
 
 		 182 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  23.33 
 
 		 175 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  23.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  21.37 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>