39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1737 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  696    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  32.77 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  27.88 
 
 
318 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  29.64 
 
 
296 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  32.39 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  32.82 
 
 
315 aa  110  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  28.95 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  26.07 
 
 
336 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  27.35 
 
 
523 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  23.17 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  25.19 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  23.72 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  24.06 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  24.58 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  25.38 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  27.08 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  24.16 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  23.99 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  24.4 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  25 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  25 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  32.8 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  27.95 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  24.15 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  29.95 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  31.72 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  31.72 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  31.72 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  24.73 
 
 
337 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  24.73 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  24.73 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  24.73 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  26.67 
 
 
323 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  29.25 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  27.61 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  23.63 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  23.63 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  23.08 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25160  hypothetical protein  19.43 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>