38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4055 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  64.41 
 
 
336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  60.59 
 
 
336 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  64.6 
 
 
336 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  50.85 
 
 
345 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  49.15 
 
 
345 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  52.01 
 
 
342 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  48.3 
 
 
345 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  51.44 
 
 
342 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  51.44 
 
 
342 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  48.58 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  49.27 
 
 
338 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  34.43 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  32.92 
 
 
337 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  29.75 
 
 
337 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  29.75 
 
 
337 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  29.75 
 
 
337 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  30.84 
 
 
337 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  30.38 
 
 
337 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  30.38 
 
 
337 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  30.38 
 
 
337 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  29.57 
 
 
332 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  28.48 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  28.49 
 
 
360 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  28.19 
 
 
364 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  28.19 
 
 
364 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  28.99 
 
 
360 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  25.38 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  24.23 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  27.05 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  26.22 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  23.97 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  24.03 
 
 
523 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  29.7 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  22.57 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  25.77 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  22.82 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>