38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1927 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  658    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  30.62 
 
 
336 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  30 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  28.48 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  28.99 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  34.1 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  30.31 
 
 
338 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  29.25 
 
 
337 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  29.25 
 
 
337 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  29.25 
 
 
337 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  29.37 
 
 
364 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  29.85 
 
 
337 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  31.38 
 
 
338 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  29.04 
 
 
364 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  29.37 
 
 
360 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  28.71 
 
 
360 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  29.76 
 
 
337 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  29.76 
 
 
337 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  28.78 
 
 
337 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  28.77 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  28.42 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  30.59 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  28.97 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  28.97 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  29.03 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  29.36 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  28.97 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  28.7 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  25.81 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  23.57 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  25.65 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  28.21 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  26.67 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  26.04 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  32.81 
 
 
523 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25160  hypothetical protein  25.8 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  24.83 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  24.31 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>