28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0874 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  633  1e-180  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  26.1 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  27.95 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  24.48 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  24.26 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  23.71 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  27.69 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  22.39 
 
 
373 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  26.16 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  28.68 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  28.68 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  26.6 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  26.34 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  27.13 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  25.23 
 
 
345 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  30 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  26.09 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  26.34 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  25.56 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  26.19 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  26.74 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  23.08 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  24.07 
 
 
342 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  24.07 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>