38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3924 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  98.83 
 
 
342 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  97.37 
 
 
342 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  73.33 
 
 
345 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  73.33 
 
 
345 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  72.46 
 
 
345 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  71.59 
 
 
345 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  52.87 
 
 
340 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  51.74 
 
 
336 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  49.13 
 
 
336 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  52.33 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  48.27 
 
 
338 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  30.65 
 
 
338 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  30.54 
 
 
337 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  31.44 
 
 
337 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  31.14 
 
 
337 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  30.24 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  31.14 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  30.24 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  30.84 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  26.16 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  29.03 
 
 
360 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  28.9 
 
 
364 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  29.68 
 
 
364 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  29.75 
 
 
360 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  25.61 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  25.93 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  25.61 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  23.05 
 
 
296 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  23.68 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  31.73 
 
 
330 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  28.57 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  23.27 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  27.2 
 
 
523 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  24.82 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  24.07 
 
 
324 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  21.36 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>