39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3651 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  71.94 
 
 		 336 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  69.25 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  64.6 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  53.47 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  51.59 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  51.73 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  50.72 
 
 		 345 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  49.85 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  52.03 
 
 		 342 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  52.03 
 
 		 342 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  51.45 
 
 		 342 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  31.44 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  30.68 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  31.51 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  28.05 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  29.14 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  27.61 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  27.91 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  28.83 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  27.22 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  27.22 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  30.74 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  29.19 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  29.43 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  28.8 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  28.86 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  26.5 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  28.41 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  24.32 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  25.61 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  29.57 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  24.24 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  24.48 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  25.53 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  22.47 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25160  hypothetical protein  21.79 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  27.49 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>