39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2740 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  688    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  58.28 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  40.65 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  39.76 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  39.76 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  39.76 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  40.36 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  40.36 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  40.06 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  36.28 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  30.72 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  32.6 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  33.53 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  32.92 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  32.74 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  31.83 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  31.94 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  30.95 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  31.53 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  31.95 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  31.95 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  31.44 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  31.01 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  31.01 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  29.25 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  30.7 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  34.1 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  26.69 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  28.97 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  24.91 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  25.91 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  24.33 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  22.54 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  26.49 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  31.25 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  29.25 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  22.86 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25160  hypothetical protein  18.64 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  25.56 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>