38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3556 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  37.46 
 
 
337 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  37.46 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  37.46 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  37.76 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  37.46 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  37.46 
 
 
337 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  37.17 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  36.73 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  36.28 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  29.7 
 
 
345 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  28.53 
 
 
345 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  30.24 
 
 
345 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  29.46 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  29.57 
 
 
340 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  30.22 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  28.79 
 
 
336 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  29.75 
 
 
338 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  29.28 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  29.28 
 
 
342 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  29.68 
 
 
336 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  28.9 
 
 
342 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  26.83 
 
 
360 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  27.68 
 
 
364 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  28.42 
 
 
323 aa  86.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  26.83 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  28.71 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  27.31 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  30.67 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  31.03 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  31.53 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  23.86 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  22.92 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  27.61 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  26.61 
 
 
523 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  25 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  21.17 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>