37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2556 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  86.39 
 
 		 364 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  86.94 
 
 		 364 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  86.39 
 
 		 360 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  35.06 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  29.25 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  28.71 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  28.99 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  32.29 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  28.2 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  27.71 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  32.89 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  32.89 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  27.99 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  31.84 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  28.48 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  32.29 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  32.29 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  26.45 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  27.19 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  27.91 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  28.71 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  26.23 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  27.23 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  28.02 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  32.8 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  24.18 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  25.33 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  21.8 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  29.01 
 
 		 523 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  24.84 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>