37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0158 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  81.25 
 
 
336 aa  577  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  69.05 
 
 
336 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  60.59 
 
 
340 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  51.16 
 
 
345 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  51.78 
 
 
338 aa  350  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  49.13 
 
 
345 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  48.84 
 
 
345 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  49.57 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  48.55 
 
 
342 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  48.55 
 
 
342 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  48.26 
 
 
342 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  30.72 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  30.4 
 
 
338 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  28.53 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  28.4 
 
 
337 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  28.83 
 
 
337 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  29.54 
 
 
337 aa  135  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  29.54 
 
 
337 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  28.83 
 
 
337 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  28.53 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  28.79 
 
 
332 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  30.62 
 
 
323 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  28.27 
 
 
364 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  30 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  30.4 
 
 
360 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  27.71 
 
 
360 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  25.19 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  26.95 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  26.02 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  22.73 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  23.22 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  23.28 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  28.86 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  27.08 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  28.11 
 
 
373 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  20.74 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>