More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0324 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0324  MoeB/thiF family protein  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  62.56 
 
 
216 aa  262  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.67 
 
 
214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.592704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0001  MoeB/ThiF family protein  60.38 
 
 
219 aa  236  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000255944  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1314  ThiF family protein  55.66 
 
 
226 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0318  thiF family protein  58.88 
 
 
217 aa  204  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0340  thiF family protein  58.88 
 
 
216 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1535  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50 
 
 
292 aa  202  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1669  thiF family protein  57.94 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1382  HesA/MoeB/ThiF family protein  56.13 
 
 
217 aa  188  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.33 
 
 
254 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.06 
 
 
254 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.97 
 
 
244 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.61 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.69 
 
 
253 aa  118  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 
255 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.78 
 
 
244 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.41 
 
 
258 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.94 
 
 
261 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.06 
 
 
254 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.95 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.58 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.73 
 
 
258 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  40.62 
 
 
255 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.47 
 
 
244 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.38 
 
 
242 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  40.1 
 
 
255 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.58 
 
 
255 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.1 
 
 
255 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34 
 
 
255 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  31.76 
 
 
255 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.2 
 
 
249 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.95 
 
 
256 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.56 
 
 
263 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.95 
 
 
254 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  33.47 
 
 
269 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.81 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  40.31 
 
 
258 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000394678  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.04 
 
 
267 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  36.05 
 
 
247 aa  98.6  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  34.2 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.88 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.88 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 
246 aa  98.2  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.9 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.07 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.69 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.31 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.22 
 
 
257 aa  95.1  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  31.02 
 
 
437 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.92 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.27 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.39 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.39 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  36.24 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.71 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  29.8 
 
 
276 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  37.34 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  37.34 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000336589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.65 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  31.73 
 
 
268 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  31.73 
 
 
268 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3064  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.46 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.57 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  31.73 
 
 
268 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  31.73 
 
 
268 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 
286 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.86 
 
 
277 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  34.03 
 
 
275 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  32.47 
 
 
300 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.03 
 
 
275 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  31.73 
 
 
268 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  34.03 
 
 
275 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  30.2 
 
 
302 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.83 
 
 
273 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.44 
 
 
274 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.66 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.35 
 
 
269 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.96 
 
 
264 aa  85.9  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.51 
 
 
300 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.51 
 
 
300 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  33.33 
 
 
268 aa  85.1  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.8 
 
 
275 aa  85.1  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.28 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.6 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.23 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.95 
 
 
271 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  33.49 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.95 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  33.71 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41002  predicted protein  29.74 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.23 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>