More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4197 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  99.26 
 
 
271 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  97.03 
 
 
269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  95.91 
 
 
269 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  77.99 
 
 
276 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  79.93 
 
 
270 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  79.48 
 
 
276 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  79.25 
 
 
270 aa  417  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3064  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  78.36 
 
 
269 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49350  hypothetical protein  77.07 
 
 
270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0144415  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  75.56 
 
 
270 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.37 
 
 
259 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  56.42 
 
 
269 aa  322  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  58.27 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  56.03 
 
 
269 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  59.36 
 
 
277 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.85 
 
 
266 aa  318  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.266567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.61 
 
 
268 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.43 
 
 
275 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01865  HesA/MoeB/ThiF family protein  61.81 
 
 
258 aa  314  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  59.22 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  59.22 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  59.22 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  59.22 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.37 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.37 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4007  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  61.42 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  hitchhiker  0.0000000536443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  59.61 
 
 
266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  59.22 
 
 
268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  56.98 
 
 
275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0735  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.24 
 
 
277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  decreased coverage  0.0000365596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  59.61 
 
 
268 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.61 
 
 
268 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  59.61 
 
 
268 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.61 
 
 
268 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  59.61 
 
 
268 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  59.61 
 
 
268 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4150  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.08 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0818457  normal  0.243283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.02 
 
 
272 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0542286  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.14 
 
 
277 aa  311  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  59.61 
 
 
268 aa  311  7.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.59 
 
 
275 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  56.59 
 
 
275 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  58.82 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.52 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  54.79 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0763  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.85 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.568059  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3895  HesA/MoeB/ThiF family protein  58.66 
 
 
267 aa  305  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.44 
 
 
268 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.53 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65754  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.53 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859159  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.53 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.456786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.53 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.69 
 
 
270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0780  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.65 
 
 
270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  54.8 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3258  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.39 
 
 
268 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0688  hypothetical protein  56.35 
 
 
271 aa  299  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.03 
 
 
267 aa  295  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2895  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  62.2 
 
 
274 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  53.18 
 
 
272 aa  285  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  50.78 
 
 
255 aa  279  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3049  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  51.78 
 
 
270 aa  268  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.59 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50.58 
 
 
295 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  50 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.78 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  50 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.45 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.69 
 
 
265 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.93 
 
 
300 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.67 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.93 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0884  molybdopterin biosynthesis protein  46.69 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167114  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  44.6 
 
 
300 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.81 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315425  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.8 
 
 
285 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
285 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.8 
 
 
285 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.39 
 
 
285 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
285 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
285 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.98 
 
 
285 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
288 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
288 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
288 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
288 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
288 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
288 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.19 
 
 
341 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.79 
 
 
288 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.39 
 
 
274 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.89 
 
 
267 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.89 
 
 
267 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
265 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04809  molybdopterin biosynthesis protein  49.21 
 
 
276 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.66 
 
 
247 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.04 
 
 
296 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3397  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.59 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.056672  normal  0.0184534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1726  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.6 
 
 
260 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0402438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>