More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1535 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1535  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
292 aa  588  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.55 
 
 
214 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.592704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  52.38 
 
 
216 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0324  MoeB/thiF family protein  50 
 
 
215 aa  200  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0001  MoeB/ThiF family protein  49.05 
 
 
219 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000255944  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1314  ThiF family protein  44.29 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1382  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.31 
 
 
217 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1669  thiF family protein  48.58 
 
 
216 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0318  thiF family protein  48.11 
 
 
217 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0340  thiF family protein  47.64 
 
 
216 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.8 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.73 
 
 
261 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.13 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.63 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.08 
 
 
254 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 
258 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.57 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.69 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.82 
 
 
249 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  35.08 
 
 
252 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.49 
 
 
244 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  35.05 
 
 
255 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 
256 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 
253 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.71 
 
 
246 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.03 
 
 
286 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.85 
 
 
255 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.5 
 
 
264 aa  106  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.23 
 
 
267 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.23 
 
 
267 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.91 
 
 
267 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.01 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.18 
 
 
246 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  30.62 
 
 
285 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.87 
 
 
244 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.49 
 
 
255 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.62 
 
 
242 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.8 
 
 
262 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.31 
 
 
288 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.47 
 
 
242 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.12 
 
 
246 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
288 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
288 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
288 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
341 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
288 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
288 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  32.38 
 
 
247 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  28.52 
 
 
276 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.84 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 
244 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.34 
 
 
288 aa  99  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.84 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.09 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.61 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.6 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.99 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  27.78 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  30.62 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  38.12 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  38.12 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  27.78 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  27.78 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 
253 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.37 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.51 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  37.74 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  28.97 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  37.74 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  37.74 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  37.74 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  28.97 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  28.97 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  37.74 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  37.74 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  28.97 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  28.97 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.13 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.51 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.22 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.22 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.51 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  26.98 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.97 
 
 
285 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.23 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.49 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.79 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  32.96 
 
 
437 aa  93.2  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  37.11 
 
 
255 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.04 
 
 
272 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.23 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.11 
 
 
255 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>