More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1382 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1382  HesA/MoeB/ThiF family protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0340  thiF family protein  89.25 
 
 		 216 aa  332  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0318  thiF family protein  88.79 
 
 		 217 aa  330  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1669  thiF family protein  88.79 
 
 		 216 aa  328  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  59.07 
 
 		 216 aa  259  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.95 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.592704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0001  MoeB/ThiF family protein  57.21 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000255944  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0324  MoeB/thiF family protein  56.13 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1314  ThiF family protein  52.56 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1535  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.31 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.62 
 
 		 242 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.97 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.83 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.39 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.97 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.04 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.67 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.08 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.34 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  31.62 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.64 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.48 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.74 
 
 		 242 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  33.72 
 
 		 285 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 		 242 aa  104  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.24 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.07 
 
 		 275 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  33.07 
 
 		 275 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.1 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.83 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  33.07 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.11 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.83 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.5 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.5 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 288 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.29 
 
 		 341 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  31.62 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.24 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 		 285 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 		 285 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  32.54 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  32.54 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.68 
 
 		 285 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  32.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  33.99 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  31.35 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  32.54 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.95 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.27 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.2 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.74 
 
 		 270 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  32.02 
 
 		 268 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  32.54 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.07 
 
 		 267 aa  99  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  31.62 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  31.62 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.88 
 
 		 277 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.64 
 
 		 272 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.98 
 
 		 268 aa  98.2  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.08 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.34 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  30.49 
 
 		 302 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.59 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.07 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  33.76 
 
 		 269 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.58 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  31.41 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.76 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.24 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 		 262 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  28.4 
 
 		 276 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  39.35 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.77 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.77 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>