35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0360 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0360  lipoprotein  100 
 
 
272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4681  hypothetical protein  54.32 
 
 
249 aa  290  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0150  lipoprotein  50.41 
 
 
251 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2353  hypothetical protein  34.94 
 
 
408 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1842  hypothetical protein  26.12 
 
 
163 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2868  ankyrin repeat protein  34.62 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1947  hypothetical protein  25.53 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.222699  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2426  ankyrin repeat protein  34.62 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.510549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2472  hypothetical protein  38.36 
 
 
133 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  44.64 
 
 
200 aa  48.9  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1944  hypothetical protein  29.21 
 
 
176 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253579  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  37.5 
 
 
954 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2213  hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  42.86 
 
 
490 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0989  hypothetical protein  27.85 
 
 
173 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.967035  normal  0.180988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1586  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.404669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2884  ankyrin  37.14 
 
 
163 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00861842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  39.13 
 
 
1585 aa  46.2  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  42.86 
 
 
149 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2657  ankyrin  32.05 
 
 
163 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  40.32 
 
 
225 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3108  hypothetical protein  25.69 
 
 
448 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000141224  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 
1030 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  44.64 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1978  hypothetical protein  27.19 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000120244  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  33.33 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  33.33 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  41.07 
 
 
149 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  29 
 
 
870 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2933  conserved hypothetical protein-like protein  24.69 
 
 
175 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2418  hypothetical protein  27.33 
 
 
163 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  46.43 
 
 
217 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  34.78 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  40.62 
 
 
404 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  35 
 
 
811 aa  42.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>