14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1944 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1944  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  350  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1947  hypothetical protein  47.17 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.222699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2933  conserved hypothetical protein-like protein  26.59 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1586  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.404669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0989  hypothetical protein  29.06 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.967035  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1842  hypothetical protein  28.7 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1978  hypothetical protein  31.88 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000120244  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0360  lipoprotein  27.21 
 
 		 272 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4681  hypothetical protein  28.89 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0150  lipoprotein  25 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2353  hypothetical protein  29.89 
 
 		 408 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1106  hypothetical protein  31.88 
 
 		 450 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4199  hypothetical protein  30.43 
 
 		 450 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>