24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0150 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0150  lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4681  hypothetical protein  58.8 
 
 		 249 aa  331  9e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0360  lipoprotein  50.41 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2353  hypothetical protein  37.55 
 
 		 408 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1842  hypothetical protein  38.14 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2418  hypothetical protein  32.71 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1586  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.404669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0989  hypothetical protein  34.52 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.967035  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2213  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2933  conserved hypothetical protein-like protein  24.67 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2884  ankyrin  44.44 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00861842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3108  hypothetical protein  27.13 
 
 		 448 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000141224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2657  ankyrin  34.25 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2426  ankyrin repeat protein  34.25 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.510549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1947  hypothetical protein  24.69 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.222699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1944  hypothetical protein  26.19 
 
 		 176 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0598  hypothetical protein  34.29 
 
 		 441 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2868  ankyrin repeat protein  32.88 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  35.71 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2701  Ankyrin  26.89 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.575669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  35.71 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  35.53 
 
 		 1030 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08550  ankyrin repeat-containing protein  27.78 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454701 
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  31.51 
 
 		 224 aa  42  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>