12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1978 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000120244  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3631  hypothetical protein  30.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2353  hypothetical protein  27.11 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0989  hypothetical protein  30.5 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.967035  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1842  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1586  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 153 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.404669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2213  hypothetical protein  31.67 
 
 		 153 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1947  hypothetical protein  29.55 
 
 		 164 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.222699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4681  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0360  lipoprotein  27.19 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1944  hypothetical protein  31.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2418  hypothetical protein  28.4 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>