22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0024 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  100 
 
 		 373 aa  742    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  27.12 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  23.76 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  22.62 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  23.2 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  22.97 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  29.27 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  26.8 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  33.33 
 
 		 425 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  31.71 
 
 		 426 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  27.2 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  30.65 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  28.93 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  23.8 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  30.33 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  28.1 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  18.38 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  29.37 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  26.12 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  28.69 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  21.23 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  25.58 
 
 		 465 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>