126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3595 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 
126 aa  246  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  95.24 
 
 
126 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  80.33 
 
 
127 aa  173  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  39.42 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.42 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  39.42 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.42 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0531  hypothetical protein  40.71 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  36.79 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  36.79 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5535  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.37 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3710  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.37 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0899837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4929  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.78 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0804759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1185  hypothetical protein  30.1 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.81082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4554  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.67 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3809  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.67 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.96 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3715  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.67 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50018  normal  0.368133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  39.22 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  38 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  38 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.79 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2287  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.56 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.779775  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  35.79 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.79 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2639  hypothetical protein  36.67 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0663774  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0291  hypothetical protein  36.67 
 
 
254 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.17 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1438  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1635  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2500  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0591091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  32.63 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  32.63 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.63 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.68 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0256  hypothetical protein  36.67 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.432418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0935  transmembrane protein  36.67 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47130  hypothetical protein  39.56 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4067  hypothetical protein  39.56 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.97 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0125  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.97 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.97 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.97 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.97 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  32.97 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  32.97 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.87 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  32.97 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  32.97 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.87 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.97 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.21 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2645  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02193  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.651276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1391  protein of unknown function DUF883 ElaB  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  31.87 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2412  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2563  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1382  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2421  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.19 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3408  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.203489  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02152  hypothetical protein  45.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.636722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.7 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.44 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  30.85 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  33.66 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  34.83 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2539  hypothetical protein  41.43 
 
 
101 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151074  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2496  hypothetical protein  41.43 
 
 
101 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.348949  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2655  hypothetical protein  41.43 
 
 
101 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2447  hypothetical protein  41.43 
 
 
101 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.653113  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2551  hypothetical protein  41.43 
 
 
101 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.937383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  33.71 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.32 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  37.29 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.59 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.26 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  37.29 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>