105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3710 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5535  protein of unknown function DUF883, ElaB  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3710  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0899837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4929  protein of unknown function DUF883 ElaB  92.97 
 
 		 128 aa  201  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0804759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4554  protein of unknown function DUF883, ElaB  91.41 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3809  protein of unknown function DUF883, ElaB  91.41 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3715  protein of unknown function DUF883 ElaB  91.41 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50018  normal  0.368133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2287  protein of unknown function DUF883, ElaB  91.41 
 
 		 128 aa  199  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.779775  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0531  hypothetical protein  65.62 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2639  hypothetical protein  67.19 
 
 		 222 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0663774  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0291  hypothetical protein  67.19 
 
 		 254 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1438  hypothetical protein  67.19 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1635  hypothetical protein  67.19 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2500  hypothetical protein  67.19 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0591091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0256  hypothetical protein  67.19 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.432418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0935  transmembrane protein  67.19 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.7 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  35.78 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.77 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.78 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.96 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  34.83 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  34.83 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.83 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1445  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.7 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.2 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  35.42 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.58 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  32.04 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1185  hypothetical protein  27.62 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.81082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.58 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  31 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.11 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.46 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  33.7 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.83 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  30.34 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  31.46 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  33.71 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  31.46 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  33.03 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.61 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  33.03 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  31.46 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.34 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.34 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  30 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.43 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  30.34 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2953  hypothetical protein  29.63 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.21 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02528  hypothetical protein  30.19 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1011  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.19 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  29.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  29.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  29.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2808  hypothetical protein  30.19 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1034  hypothetical protein  30.19 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2792  hypothetical protein  29.63 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3207  hypothetical protein  30.19 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3914  hypothetical protein  30.19 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02492  hypothetical protein  30.19 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  33.96 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  33.96 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  29.21 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2551  hypothetical protein  30.14 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.937383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2447  hypothetical protein  30.14 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.653113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2496  hypothetical protein  30.14 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.348949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3001  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.689842  hitchhiker  0.00644844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2984  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.159967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2539  hypothetical protein  30.14 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.297452  normal  0.0137212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>