122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3000 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  54.13 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  54.13 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  54.08 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  56.12 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  56.12 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  50.49 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  49.51 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  47.62 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  48.57 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  46.79 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  41.84 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  44.55 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  43 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  43 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.37 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.37 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.37 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.37 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.37 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.36 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  38 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  39 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.36 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.36 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  38.38 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  35.64 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  35.64 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.38 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  35.64 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  35.35 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  39.18 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1185  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.81082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.39 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.73 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.98 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4067  hypothetical protein  38.2 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1813  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.77 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.04 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  37 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2189  hypothetical protein  39.08 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47130  hypothetical protein  37.08 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3548  protein of unknown function DUF883, ElaB  40.74 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.32 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  33 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0060  hypothetical protein  35.87 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0769  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.8 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.754724  normal  0.0525304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0703  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.8 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531721  normal  0.133023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0753  hypothetical protein  37.8 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.286426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.67 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  29.67 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  32.58 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2655  hypothetical protein  35.9 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.99 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.71 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  32.99 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  31.52 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  31.52 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.52 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.96 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0971  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.69 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  31.87 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.97 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0803  hypothetical protein  33.75 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3718  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.52 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4554  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.56 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3809  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.56 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3715  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.56 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50018  normal  0.368133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4929  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.33 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0804759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2287  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.44 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.779775  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1445  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0531  hypothetical protein  31.11 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.89 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5535  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.33 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2953  hypothetical protein  26.85 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2792  hypothetical protein  26.85 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3710  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.33 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0899837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3914  hypothetical protein  26.85 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>