144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0547 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  78.22 
 
 		 101 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  78.22 
 
 		 101 aa  157  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  76.24 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  75.25 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  69.31 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  65.35 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  59.41 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3718  protein of unknown function DUF883 ElaB  54.12 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1445  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.36 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.89 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  42.39 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  42.39 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  42.39 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2792  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2953  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02528  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1011  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.71 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02492  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3914  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3207  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2808  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1505  hypothetical protein  44.19 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2759  hypothetical protein  44.19 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.2 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3286  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.82 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2645  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02193  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.651276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1391  protein of unknown function DUF883 ElaB  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2655  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3408  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.203489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3107  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal  0.930636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2949  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.297452  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2539  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3001  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.689842  hitchhiker  0.00644844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2918  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2816  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02152  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.636722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2412  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2563  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1382  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2421  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.473701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2496  hypothetical protein  43.06 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.348949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2984  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.159967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  33.94 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2551  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.937383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2447  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.653113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  33.94 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.52 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  34.83 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3152  hypothetical protein  37.89 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000423354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.91 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  29 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  30.85 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  32.98 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  30.85 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  30.85 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  30.85 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  30.85 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  30.85 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  30.85 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0156  hypothetical protein  35.42 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0036  hypothetical protein  34.38 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.91 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.74 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.71 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.79 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.79 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4554  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.83 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3809  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.83 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3715  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.83 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50018  normal  0.368133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  30.85 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5535  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.83 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3710  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.83 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0899837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.85 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.31 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>