30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0125 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0125  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  273  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0094  hypothetical protein  64.96 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0148  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.97 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0140  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.12 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  30.6 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.6 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  51.35 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  51.35 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  31.73 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.36 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3001  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.689842  hitchhiker  0.00644844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2984  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.159967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2949  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.297452  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3107  hypothetical protein  27.88 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal  0.930636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  41.27 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  41.27 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>