93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3039 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  209  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  98.1 
 
 		 105 aa  205  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  82.86 
 
 		 105 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  68.57 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1813  protein of unknown function DUF883 ElaB  70.65 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2189  hypothetical protein  68.13 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3548  protein of unknown function DUF883, ElaB  68.13 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47130  hypothetical protein  43.12 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4067  hypothetical protein  43.12 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  44.04 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  39.82 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  39.82 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  42.2 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  43 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  40.66 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  40.37 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  40.37 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.56 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.46 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  35.92 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  37.36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  37.36 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.79 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.68 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  34.74 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.74 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  33.01 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  33.68 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  33.68 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  33.68 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  32.63 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.79 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.53 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.04 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.91 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  35.23 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0060  hypothetical protein  32.22 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.95 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  26.6 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2655  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0769  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.03 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.754724  normal  0.0525304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0703  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.03 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531721  normal  0.133023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  28.41 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0753  hypothetical protein  30.49 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.286426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  30 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  27.55 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3718  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.68 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0531  hypothetical protein  29.13 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.55 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  27.55 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  35.59 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.29 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1635  hypothetical protein  29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0256  hypothetical protein  29 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.432418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0291  hypothetical protein  30.34 
 
 		 254 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196147  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2500  hypothetical protein  29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0591091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0935  transmembrane protein  29 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1438  hypothetical protein  29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2639  hypothetical protein  30.34 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0663774  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0162  protein of unknown function DUF883 ElaB  46.34 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.28952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.09 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0803  hypothetical protein  32.43 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1185  hypothetical protein  27.27 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.81082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1445  protein of unknown function DUF883, ElaB  23.85 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1241  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.12 
 
 		 106 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00670421  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.85 
 
 		 101 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2287  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.58 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.779775  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4929  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.46 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0804759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4554  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.83 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3809  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.83 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3715  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.83 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50018  normal  0.368133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  26.53 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  26.53 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  26.53 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  26.53 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  26.53 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.216587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>