47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1259 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1259  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
110 aa  216  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.97 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.8 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.8 
 
 
112 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 
114 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.53 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  32.39 
 
 
111 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.96 
 
 
129 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.39 
 
 
111 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.39 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.99 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  30.99 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  25.81 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.99 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  23.46 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.99 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  30.16 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  30.16 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  27.88 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  23.3 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  26.42 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 
108 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
117 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  21.3 
 
 
111 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.34 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.34 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.75 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  20.75 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  23.75 
 
 
113 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
117 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>