54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05460 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  100 
 
 		 393 aa  790    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  48.98 
 
 		 398 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  47.59 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  46.94 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2839  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  41.08 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  42.31 
 
 		 418 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  40 
 
 		 430 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4768  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  34.46 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.393001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.2 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  30.93 
 
 		 446 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.84 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  31.45 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.25 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.85 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  23.15 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.99 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  27.82 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  23.85 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  22.48 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  24.69 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  26.51 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  29.07 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  28.48 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  26.51 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  26.94 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  27.64 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  27.6 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  23.08 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  23.95 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  25.41 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  26.87 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  22.51 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.94 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.82 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.66 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0783  5-methylcytosine restriction system component- like protein  22.81 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3525  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  46.88 
 
 		 72 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114159  normal  0.670947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  25.72 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.25 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1283  5-methylcytosine restriction system component- like protein  19.72 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000503694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  25.2 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1910  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.86 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4503  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.25 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.544571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1561  5-methylcytosine restriction system component- like protein  19.58 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  28.64 
 
 		 273 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2863  5-methylcytosine restriction system component- like protein  28.78 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.95 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3753  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  26.17 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.537146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0401  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0940  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  29.66 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000244795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  28.06 
 
 		 1745 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  28.06 
 
 		 1745 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  25 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>