51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2661 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  886    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  43.37 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  42.48 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  36.41 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  41.37 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  38.44 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  40.88 
 
 		 424 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  40.8 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  36.08 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  39.46 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  37.82 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  36.86 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  37.31 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  43.8 
 
 		 267 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  43.68 
 
 		 273 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  32.55 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  31.88 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  31.35 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  30.35 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  35.55 
 
 		 288 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  27.49 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  31.23 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  29.2 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.28 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  24.86 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.55 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  24.29 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.48 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.22 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.3 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  33.33 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  21.15 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0828  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.04 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0845  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.04 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  26.36 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.79 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_002950  PG0972  hypothetical protein  23.75 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.241373 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4503  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.31 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.544571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  34.83 
 
 		 164 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.03 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1910  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.99 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  25.43 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.47 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  22.73 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0230  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.66 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.04 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0783  5-methylcytosine restriction system component- like protein  22.46 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0940  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  27.09 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000244795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  21.43 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1353  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  23.69 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239039 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0952  hypothetical protein  27.45 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>