27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0227 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1055    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  77.94 
 
 		 498 aa  762    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2030  hypothetical protein  27.41 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  24.53 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  24.84 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  22.54 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  22.07 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  21.84 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  22.96 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  22.59 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  23.78 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  21.32 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  21.36 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  21.11 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.75 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  26.44 
 
 		 267 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  23.03 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  26.67 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  23.62 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  21.53 
 
 		 288 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  20.83 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  22.53 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.15 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.47 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  23.37 
 
 		 426 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  19.9 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  26.11 
 
 		 687 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>