27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0437 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  100 
 
 		 164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  36.55 
 
 		 426 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  35.04 
 
 		 437 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  36.94 
 
 		 429 aa  84.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  40.24 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  40.24 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  35.9 
 
 		 687 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  40.24 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  47.62 
 
 		 460 aa  61.2  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  33 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  40.48 
 
 		 435 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  31 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  34.83 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  34.44 
 
 		 437 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  33.77 
 
 		 428 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  41.27 
 
 		 422 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  36.76 
 
 		 416 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  32.5 
 
 		 428 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  39.06 
 
 		 436 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  36 
 
 		 273 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  36.76 
 
 		 428 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  32.94 
 
 		 453 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0225  conserved hypothetical protein, putative endonuclease  58.06 
 
 		 208 aa  44.3  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.131581  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  30.85 
 
 		 445 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  32.53 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>