55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0993 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  868    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  29.46 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  27.94 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  27.49 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  30.81 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  26.53 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  29.05 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  27.82 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.11 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  27.03 
 
 		 445 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  25.84 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.81 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  25.08 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  25.3 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.3 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  25.52 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.49 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  26.13 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  28.79 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  26.1 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.92 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  25.68 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.38 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  35.04 
 
 		 164 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.63 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  23.15 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.04 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.74 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.02 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  26.75 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  24.04 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  24.31 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  22.57 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.44 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0972  hypothetical protein  22.32 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.241373 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0952  hypothetical protein  25.15 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0879  hypothetical protein  24.5 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0515666  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4503  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  22.07 
 
 		 361 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.544571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  22.75 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.24 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1561  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.06 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1283  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.72 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000503694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0783  5-methylcytosine restriction system component- like protein  24.28 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  25.93 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0828  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  20.99 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0845  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  20.99 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.27 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6932  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  21.4 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0940  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  20.86 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000244795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1353  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  20.83 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0230  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.88 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0401  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.47 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>