35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0643 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0643  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208458  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0676  hypothetical protein  97.3 
 
 
296 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0193  hypothetical protein  97.11 
 
 
242 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.502309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2707  hypothetical protein  82.49 
 
 
293 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2421  hypothetical protein  69.29 
 
 
377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2608  hypothetical protein  69.29 
 
 
286 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3416  hypothetical protein  69.61 
 
 
371 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.630747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0337  hypothetical protein  69.29 
 
 
286 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1198  hypothetical protein  69.29 
 
 
286 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3423  hypothetical protein  68.2 
 
 
371 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3381  hypothetical protein  69.96 
 
 
280 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1231  hypothetical protein  70.11 
 
 
354 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000281184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3356  hypothetical protein  63.7 
 
 
275 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000221362  hitchhiker  0.00000177169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0603  hypothetical protein  62.59 
 
 
275 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00959677  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  57.49 
 
 
321 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0488  putative transmembrane protein  53.26 
 
 
270 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0465  putative transmembrane protein  49.63 
 
 
266 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0011983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0364  putative transmembrane protein  52.22 
 
 
266 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0428854  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0407  hypothetical protein  48.55 
 
 
262 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851089  normal  0.0723479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0379  putative transmembrane protein  53.41 
 
 
265 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494344  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2385  hypothetical protein  35.02 
 
 
351 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.370003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2062  hypothetical protein  35.87 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1031  putative transmembrane protein  46.74 
 
 
267 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.14638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3024  putative transmembrane protein  45.96 
 
 
257 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.931327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3743  putative transmembrane protein  45.96 
 
 
257 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4317  putative transmembrane protein  44.89 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0858  putative transmembrane protein  47.19 
 
 
246 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3449  putative transmembrane protein  48.37 
 
 
224 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0669267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1387  putative transmembrane protein  43.21 
 
 
269 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0508  putative transmembrane protein  39.45 
 
 
258 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0076  hypothetical protein  37.66 
 
 
277 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0885  putative transmembrane protein  39.07 
 
 
262 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.968622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2953  hypothetical protein  29.86 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00176502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2864  putative putative transmembrane protein  36.24 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02719  probable putative transmembrane protein  29.58 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>